《长相守》中花锦绣恨花木槿的原因主要有两点：
羡慕嫉妒：花锦绣和花木槿虽为孪生姐妹，但命运却截然不同。花木槿聪颖过人，凭借智慧和《商训》在原家站稳脚跟，并助原家击败群雄、成就霸业，赢得了众人的尊重和敬仰。相比之下，花锦绣可能感到自己不如姐姐出色，这种羡慕嫉妒的情绪逐渐累积，最终转化为对花木槿的恨意。
想法相左与权力欲望：花锦绣经历了柳言生的玷污事件后，内心发生了巨大变化，渴望拥有更多的权利来保护自己并报复那些伤害过她的人。然而，花木槿的想法却是与妹妹远离纷争，过上平凡的生活。这种在权力欲望和生活态度上的巨大分歧，使得姐妹两人的关系渐行渐远，花锦绣也因此更加怨恨花木槿。
