历史上国防部曾有第五、六、七、十研究院四个研究院。
国防部第五研究院于1956年10月8日成立，钱学森希望将行政事务与技术研究分开，此后刘亚楼兼任院长，王秉璋兼任副院长，钱学森负责研究设计工作。随着航空、舰艇、电子三个研究院的成立，五院研究领域得以拓展，在导弹、运载火箭技术等领域取得丰硕成果。
国防部第六研究院成立大会于1961年6月12 - 30日在北京东交民巷的空军第三招待所礼堂召开，刘亚楼上将出席并作报告，为其建立奠定基础。
国防部第七研究院成立大会于1961年6月9日在北京海军大礼堂召开，刘华清海军少将任七院院长，为我国海军科研事业注入新活力。
国防部第十研究院成立大会于1961年5月在中国人民解放军总字721部队举行，执行兵团级权限。
文革期间，这四大研究院回归军队系统进行重组，被冠名为中国人民解放军，执行军级权限。它们在发展过程中，不仅为我国国防事业做出卓越贡献，也在科技创新方面探索出可行之路，完善了我国军事科研体系。不过关于当下国防部具体有几个研究院，文中未提及相关内容。
