《飞花如蝶》以二十世纪三十年代为背景，讲述了女子越剧班彩凤班与强盗关大义之间跌宕起伏的传奇故事，全剧共26集。
彩凤班是越剧之乡嵊县闻名的戏班，以十一个凤姑娘闻名。一次，凤姑娘们练完功在溪边玩耍时，遭遇黑风寨强盗关大义。头肩花旦萧丹凤凭借机智让关大义遵守诺言放了她们，关大义也被丹凤吸引，情愫暗生。后来，萧丹凤被寨主仇叔抢上山欲做压寨夫人，关大义杀寨主救下她。丹凤虽喜欢关大义，但因立志献身越剧，未应承求婚。
与关大义一起长大的仇青凤，因嫉妒他对丹凤的感情，赌气下山学戏，误打误撞进了彩凤班。彩凤班前往上海，关大义先行赶到暗中保护，还买下茶馆让她们落脚。然而，演出遭上海青帮流氓马日升破坏。关大义拜访马日升时，意外得知其与自己父亲是同盟会结义兄弟。马日升觊觎丹凤美色，欲娶她为姨太太。
关大义在马公馆见到昔日情人棋儿，她已被马日升抢为九姨太。马日升想借刀杀人除掉关大义，因他当年开枪打死关大义父亲并霸占关家财产。关大义成功脱险，结义兄弟关仁却身中数弹跌入黄浦江。彩凤班因未推出新戏观众流失，此时关大义父亲生前的红颜知己窦男出钱包戏，鼓励丹凤认真唱戏、清白做人。
在进步人士郭云龙帮助下，关大义买下长虹戏院，彩凤班有了新舞台。她们锐意创新，排练的《梁祝哀史》引起轰动，后又排出《花木兰》获空前成功。马日升企图认丹凤为过房女儿、用金钱引诱，均未得逞，还绑架关大义、重伤仇青凤。关大义宁死不屈，逃脱后发现马日升是杀父仇人且投靠日本人做汉奸，痛下决心为国除害，可惜刺杀未果。
马日升举办越剧皇后评选，丹凤获桂冠后当众毁坏凤冠。他又设圈套擒获关大义，萧丹凤为救关大义和棋儿，答应解除与关大义的婚约。关大义佯装落魄为黄包车夫等待复仇时机，仇青凤暗中帮助彩凤班。最终，在马公馆娶亲之日，关大义与窦男联手刺杀马日升。关大义告别丹凤投入抗日洪流，萧丹凤留在上海坚持越剧理想，多年后终成一代名伶，并与关大义重逢。
