烟腹毛脚燕的繁殖方式主要是筑巢繁殖。烟腹毛脚燕通常会在春季开始筑巢，选择岩壁裂缝、崖洞或崖顶平台上筑巢。它们会用泥土和唾液混合构建巢穴，巢穴内部通常会铺有苔藓、草叶和其他柔软的植物材料，为幼鸟提供温暖和舒适的环境。在筑巢完成后，烟腹毛脚燕会开始产卵，通常每次产卵2-4枚。卵的颜色通常为白色或淡蓝色，表面有细密的斑点或纹理。雌鸟会负责孵化卵，而雄鸟则会负责觅食和守卫巢穴。孵化期通常在14-16天左右，期间雌鸟会一直待在巢穴内，用体温孵化卵。孵化出幼鸟后，雌鸟和雄鸟会共同喂养幼鸟。它们会捕捉昆虫等小型无脊椎动物，将食物送到幼鸟的嘴里。幼鸟在成长过程中会逐渐长出羽毛，学会飞翔和独立生活。在幼鸟能够独立生活后，它们会离开巢穴，开始自己的迁徙和繁殖生活。总之，烟腹毛脚燕的繁殖方式是一种典型的鸟类繁殖方式，通过筑巢、产卵、孵化和喂养幼鸟等过程，完成生命的延续。
