四川省2012年理科投档线中，本一批和本三批部分高校的投档线情况如下：
本一批部分高校投档线：本一批高校投档线整体较高，顶尖高校分数线普遍超过600分。其中，北京大学以660分位居榜首，清华大学647分、上海交通大学635分、北京大学医学部635分、复旦大学632分紧随其后，构成第一梯队。浙江大学626分、南京大学618分、上海财经大学602分等高校分数线也超过600分，属于高分段院校。
中分段高校中，中央财经大学599分、同济大学599分、北京航空航天大学606分等财经类、工科类院校表现突出；南开大学594分、中国政法大学592分、对外经济贸易大学613分等综合类或特色院校分数线也较高。
550-580分区间的院校包括电子科技大学567分、西安电子科技大学562分、中南财经政法大学565分等，以电子信息、财经政法类学科为优势；四川大学557分、重庆大学546分、山东大学549分等本地或区域性综合大学分数线集中在此区间。
520-550分区间的院校数量较多，如西南交通大学549分、兰州大学541分、中国农业大学541分等，涵盖交通、农林、基础学科等领域；北京化工大学539分、华东理工大学539分、东华大学539分等化工、材料类院校分数线接近。
520分以下的院校包括北京林业大学529分、陕西师范大学529分、中国矿业大学525分等，以林业、师范、矿业为特色；北京交通大学519分、武汉理工大学519分、湖南大学518分等部分高校因招生规模或专业设置因素分数线相对较低。
本三批部分高校投档线：本三批高校投档线整体低于本一批，多数院校集中在416-460分区间。北京城市学院462分为本三批最高分，北京工商大学嘉华学院443分、燕山大学里仁学院445分、河北工业大学城市学院448分等院校分数线超过440分。
430-440分区间的院校包括南开大学滨海学院436分、北京邮电大学世纪学院433分、河北科技大学理工学院458分等；其余大部分院校如天津天狮学院416分、河北工程大学科信学院416分、沈阳航空航天大学北方科技学院416分等分数线均为416分，为四川省2012年理科本三批最低控制线。
