邓世平案是通过公安机关摸排涉黑涉恶线索并审讯深挖犯罪团伙成员后，结合现场挖掘出的遗骸及DNA比对得以发现的。具体过程如下：
公安机关摸排涉黑涉恶线索：2019年4月，新晃公安局在摸排涉黑涉恶线索时，查获了该县晃州镇杜少平等人涉黑涉恶犯罪团伙，该团伙涉嫌故意伤害、非法拘禁、聚众斗殴等犯罪行为。
审讯深挖犯罪团伙成员：在强大的政策法律攻势下，公安机关对杜少平及其团伙成员罗某某、高某某进行了审讯深挖。经过审讯，这些团伙成员供认了他们杀害邓世平及埋尸的犯罪事实。
现场挖掘出遗骸：2019年6月20日，在新晃一中的操场上，随着挖掘机的不断深入，一具遗骸逐渐显露出来。遗骸被挖出后，衣物和白骨被送往长沙专业机构进行DNA提取。
DNA比对确认身份：21日，长沙专业机构来到新晃，提取了邓世平儿子和母亲的血液，以便进一步与被挖出遗骸的DNA进行比对。通过DNA比对，确认了遗骸即为邓世平的遗体。
综上所述，邓世平案的发现是公安机关在摸排涉黑涉恶线索、审讯深挖犯罪团伙成员以及现场挖掘和DNA比对等一系列工作基础上得以实现的。
