在这个世界，存在两个平行次元，它们就像镜子的两面，一边是我们所生存的物质界，另一边则是恶魔们居住的虚无界。这两个世界原本互不干涉，但恶魔却能借助某种力量进入人类的世界。那些内心充满邪恶念头的人，尤其容易成为恶魔的附体对象。而驱魔师的职责就是保护人们免受恶魔侵扰。
故事的主人公，奥村磷，是一个由恶魔撒旦与人类女子所生的男孩。在一次与收养他的藤本神父的争吵中，磷意外发现，他和他的同卵弟弟奥村雪男，并非是藤本狮郎神父的亲生儿子，而是大恶魔撒旦的私生子。在这场发现中，藤本神父受到撒旦的附体，为了保护磷，他选择了自杀。因此，磷决定对抗他恶魔之子的命运，为了报复藤本神父的牺牲，为了证明自己的存在，他立下了成为顶尖驱魔师的决心，加入驱魔塾，利用自己身为魔神的象征——蓝色火焰的力量，与撒旦进行斗争。他的驱魔师之旅由此展开。
《青之驱魔师 剧场版》源自日本女漫画家加藤和惠创作的人气漫画“青の祓魔师”。在TV动画“青の祓魔师”播出后，推出了剧场版动画，并于2012年12月28日开始上映。
