申银万国证券公司网上交易的手续费计算方法如下：在沪市交易中，手续费包括印花税、佣金和过户费。印花税的计算方式是成交金额的0.1%，佣金是成交金额的0.18%，但最低收取5元。过户费则是成交面额（面额1元）的0.1%，但最低收取1元。例如，如果您购买了一万元的股票一千股，那么手续费总和就是29元。在深市交易中，手续费计算方式与沪市相似，但没有过户费这一项。其他费用的计算方式与沪市相同。因此，如果购买同为一万元的股票一千股，手续费总和就会减少到28元。综上所述，申银万国证券公司网上交易的手续费计算方法主要依据交易金额、交易类型以及交易的交易所，其中沪市交易需考虑印花税、佣金和过户费，深市交易则只需考虑印花税和佣金。交易金额越大，手续费的计算结果也会相应增加。
