《康熙秘史》共42集，是一部融合历史、古装与言情的电视剧，以康熙亲政前后的权力斗争与情感纠葛为主线，展现了少年康熙在政治与人性间的成长历程。
权力斗争的核心脉络
康熙八年，辅政大臣之首索尼去世，康熙借机推动亲政。为探查遗诏真相，他微服至安亲王府，偶遇鳌拜之女青格儿与明珠之子纳兰性德。因未表露身份，康熙与纳兰发生口角，青格儿亦尖锐指责，孝庄及时介入救下二人，并钦定纳兰为康熙伴读。纳兰因起草神功圣德碑文获康熙赏识，留任侍卫，引发曹寅的嫉妒。
朝堂上，苏克萨哈请求取消辅政制度，乾纲独断，鳌拜势力受挫。纳兰性德以“孝”字为由，说服康熙为顺治立碑，打破朝局平衡。鳌拜主张严惩纳兰，青格儿以死相逼，孝庄最终妥协但反对青格儿嫁康熙，下旨令其与福全成婚，引发青格儿离家出走。鳌拜疑心纳兰，康熙秘密护送青格儿至端敏住处，福全得知婚约真相后对康熙生恨。
苏克萨哈遭鳌拜构陷，康熙被迫妥协，决定扳倒鳌拜。鳌拜密谋换帝，孝庄指出威胁实为亲贵王爷，联合索额图、纳兰性德与明珠制定对策。曹寅提议以青格儿为饵引鳌拜入宫，鳌拜见信后孤身赴险，被康熙等人擒获。孝庄阻止索额图杀鳌拜，将其囚禁。康熙未杀鳌拜，因青格儿身世及鳌拜无叛逆之心。
情感纠葛的多重交织
纳兰性德钟情青梅竹马的惠儿，却陷入青格儿的爱慕与惠儿的深情间两难。青格儿与惠儿因爱慕同一人而结为好友，但情感矛盾暗涌。康熙对惠儿念念不忘，曹寅将其接入宫中，与青格儿、端敏共处。福全因婚约被拒对康熙心生怨恨，朝局与私情交织，加剧人物冲突。
历史进程的推动与结局
康熙重用索额图与明珠，开启统一大业，平定三藩、收复台湾、推行博学鸿儒，奠定大一统封建王朝根基。少年皇帝在政治博弈与人性挣扎中完成蜕变，情感线则以青格儿失踪、纳兰与惠儿关系微妙变化收尾，留下开放结局。
