宗继昌的出生证明会在杭州档案馆留存，是因为他并非在美国出生，而是在1989年出生于杭州。以下是详细解释：
出生地点：根据原告方提供的诉讼材料，宗继昌的出生证明由杭州市上城区档案馆保存。这一事实直接证明了宗继昌是在杭州出生的，而非美国。
出生证明内容：出生证明中，“父亲”一栏明确写着宗庆后，这进一步确认了宗继昌与宗庆后的父子关系，并间接证明了其出生地的真实性。
时间线对比：关于宗继昌母亲杜建英曾陪同宗馥莉赴美留学的信息，是发生在宗继昌出生之后的事情。这一时间线对比说明，宗继昌的出生与杜建英的赴美留学是两个独立的事件，不存在因果关系，也不影响宗继昌在杭州出生的事实。
结论：综上所述，宗继昌的出生证明之所以会在杭州档案馆留存，是因为他确实在杭州出生，并且这一事实得到了官方档案的证实。而关于他母亲杜建英的赴美留学经历，与宗继昌的出生地无直接关联。
