邵本良的最后结局是被日军毒杀。
1936年冬，邵本良屡次被杨靖宇率领的东北抗日联军击败，他的行动耗费了日军大量资源，却劳而无功。日军本就生性多疑，邵本良这种糟糕的表现让日军对他更加不满和怀疑。之后，邵本良被送往伪满奉天陆军医院进行软禁，他失去了行动自由，处于日军的严密监控之下。
到了1937年春，日军经过评估，认为邵本良已经没有利用价值了。于是，日军吩咐医院的医生对他下毒。最终，邵本良在医院里结束了自己的生命。邵本良作为汉奸，为日军卖命，残害同胞，其最后的下场也是他应得的，他也成为了日本侵略者利益权衡下的牺牲品。
