现在当然由我国实控，有海警船在琼台礁常驻，附近海域也有我海警船在进行长期的执法巡逻。
《中国国家地理》杂志记者曾于2010年10月登上琼台礁进行实地考察，曾撰文说琼台礁已经发育成为一个出露水面的小岛，低潮时高出水面十余米，岛上有白色的珊瑚碎块、碎屑堆积，水面下则是五彩缤纷的珊瑚世界，围绕着它的是一圈环礁，长约60米，宽约20多米。
后来马来西亚警察也曾登上琼台礁。
情况发生变化是在2014年。
从地图上我们可以看见，南沙群岛最南端靠近马来西亚一侧，由两个群礁和一个曾母暗沙群组成，群礁名称分别是北康暗沙和南康暗沙，两个群礁拥有数十个水下暗滩、暗沙，而位于南康暗沙的琼台礁，是两个群礁中唯一露出水面的岛礁。琼台礁礁盘面积约有2.5平方公里，出水沙洲面积约3000平方米，沙洲上有一棵唯一活下来的棕榈树，早年由我国渔民在沙洲上栽植，沙洲也是我国渔民常年靠船休息之地。
1998年东南亚金融风暴发生前，我国对琼台礁控制较弱，一般马国军舰会在附近海域巡逻，保护它自己的海上钻井平台，我国则会派军舰对曾母暗沙和琼台礁进行象征性巡视。东南亚金融风暴发生后，我国帮助马国度过了金融危机，马国对我们的好感持续升温，两国加强深度交流，马国驱赶我渔船的事件也越来越少。
2014年3月8日马航MH370客机失联后，为了寻找失事飞机，我方派出大量搜救船只进入南中国海各国海域搜救，把南海海底彻底犁了一遍，虽然没找到失事客机，但要马方给失踪者家属一个说法。传说马方自感压力山大，通过半年的谈判博弈，马方作出妥协，我海警船常驻南康暗沙，继续在南海海域寻找失事飞机。到了4月份，琼台礁基本由我方控制。
后来新加坡《联合早报》网站2015年6月4日援引马来西亚《婆罗洲邮报》报道称，马来西亚方面称，中国海警船近两年来一直在该海域下锚。马方还表示该国海事执法局始终对该区域保持24小时监视，保卫该国“主权”。
从现实情况来看，随着我国综合国力的日益增强，南沙群岛目前的无人岛礁回归我国是必然结果。我国取得琼台礁的实控权并非轻而易举，相反是通过执法船定期巡逻，加强在此处的存在，另外则是通过与马来西亚的谈判取得实控权。
当然，马来西亚也得到了实惠，维护了在附近海域继续开采南海石油天然气的权利。
有人会问，既然琼台礁我们实控，我们为什么没在沙洲上修建基础施和派人驻守，哪怕是为渔民修一座服务站也好，主要是受《南海各方行为宣言》制约，维持现状。我们也暂时不会新占礁盘，只要坚持巡航，坚定看住这里，最终都会属于我们。
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