关于牛顿后半生在研究神学，炼金术等说法在国内好像很盛传。国外我没去过，不敢评论。
那么问题来了，如题主所说，牛顿作为人类有史以来最聪明的几个大脑之一，在26岁前就完成了大部分开创性的科学研究，前后差距为什么会这么大呢？基于存在即合理的哲学思考，我在这里试图站在牛顿的角度，分析一下人们对他的种种误区。
1.牛顿26岁之后是否在研究神学
答案是肯定的，至于其150万字的手稿，我不确定。我这里想分析的是牛顿所处的时代背景，众所周知的事，牛顿独立发现微积分，还有反射式望远镜，以及著名的万有引力定律，出版《自然哲学的数学原理》。我们不得不佩服他的大脑，钦佩之余，我们会想，如果没有牛顿，这些东西会被发现吗，如果会，需要多久能被发现。
2.牛顿的成就有哪些时代基石
(1)微积分自不用说，莱布尼茨就是有力的竞争者，其发现比牛顿晚，但发表的早。
(2)反射式望远镜呢？在此之前，伽利略听说荷兰的某个搞眼镜镜片的，发现了个神奇的有远望功能的仪器，所以伽利略自己也捣鼓起来，很快就搞出了个折射式，用于观测月球，太阳，行星，发现了木星的四颗卫星——找到了不以地球为中心的星体。有力的支援了哥白尼。由此可以看出，望远镜诞生的大背景是当时玻璃镜片技术的发展，自然而然的产生的，只是诸如伽利略，牛顿式的人物大脑比一般人好，所以发明权归属在他们手中。当时全世界有那么多人，总有几个顶尖级别的人才。
(3)万有引力定律，这个得益于望远镜的发明，使得天文观测水平得到显著的提高，科学家们能获得比前人精度更高的数据。比如最接近万有引力的，开普勒三定律，就是开普勒在其老师第古观测资料的基础上，搞“大数据”分析的结果。牛顿也说过，什么巨人肩膀之类的话。
3.牛顿的后半生为什么没啥科学成就
原因还是在时代上，牛顿之后的科学史可以证明，直到爱因斯坦出来之前，世界上的人还在牛顿打的经典力学框架下做些修修补补工作，作为一个能规划未来200多年的科学发展方向的人来说，他是远远领先与那个时代的，他后半生没能有大的成就也正是为这个时代所限。
4.这么一个聪明的大脑，研究神学是不是太可惜了
这涉及到一个人的心灵归宿问题，西方普遍信仰上帝，并不是全是宗教意义上的上帝，还有一部分人信仰的是科学上的“上帝”，比如说，爱因斯坦在反对量子力学过程中说过的那句话“上帝不掷筛子”，这就是指科学上的上帝。
牛顿研究神学的动力来源于一个最基本的bug，既然万有引力对万物都有普适性，给定一个初值，通过求解微分方程，就能预测未来，那么这个“初值”的初值是什么呢？
就像鸡生蛋，蛋生鸡一样。只有给定一个最初最初的初值，然后用经典力学列方程，就可以预知未来，这就是一种决定论的思想了。
牛顿把那个最初的初值，称作第一推动，他苦苦寻思了N久，最终回归上帝的怀抱。说第一推动是上帝给的。然后就要证明上帝的存在，证明上帝怎么万能等等，这里面就要无限的课题需要研究。所以牛顿150万字的手稿，可能就是这些东东。
5.这么一个聪明的大脑，研究炼金术是不是很浪费他的才能
最开始我看到这个问题，也是默默的为牛顿悲哀，惋惜。直到发现了他后半生另外一个大的成就以后，又更加膜拜他了。
牛顿给出了第一推动的解释后，为什么还搞炼金术呢？难道想长生不老？非也，这恰恰是他后半生伟大的地方。
先上结论，牛顿研究炼金术最主要是为了改良英国劣币当道的现实
因为各种原因，牛顿做了当时英国皇家铸币厂厂长，在他当厂长的时代，正直英国市场上劣币当道，有人在金币里面掺杂其它金属，使得市场上流通的金币纯度很差。要知道一个国家如果货币体系出现紊乱，那会爆发一大堆的问题。所以这时候铸币厂长得任务就是，提纯当前市场上的货币，发行新的，纯度达标的货币。
当时英国市场上主要有两种合法的金属货币，金币和银币，牛顿解决货币的纯度问题后，还需要解决货币的兑换汇率问题，科学家出身的他，对经济学并不是很了解(当时根本没经济学)，将金银之间的汇率按照他的理解给出了一个兑换比例，具体的数值我记不得了，总归是将银币的价格定高了，高于同时期的欧洲大陆，导致许多英国人带着本国的银币到欧洲大陆去换取金币，然后回国继续换取银币，这一来一回一倒腾，还能赚不少差价。这导致了英国大量的白银外流，直至银币渐渐稀缺。
这个时候牛顿想重新更换金银汇率已经晚了，经过一阵苦思冥想，市场调研，最终诞生了一个影响深远的制度：废除银币的货币功能，所有的交易只能用金币兑换。
牛顿给出了一个金币和英镑的比例：
每盎司黄金= 三英镑十七 先令 十又二分 之一便士
这是后世金本位值得开始，牛顿确定这个比例是在1717年。
第一个真正的金本位制度是在1816年的英国，还是遵循牛顿定的那个比例。自此之后金本位风靡全球一百多年，直至1973年布雷顿森林体系破产。
关于金本位：
以黄金作为唯一的世界货币，有许多优点，化学上，金的稳定性好，可以自然存在而不被腐蚀；颜色上接近太阳的颜色，各种金黄；最主要的是，黄金的产量是大自然在控制，比不得纸币，可以人为的想怎么发行就怎么发行。金本位的确立，那些民众就会得到一个讯息：黄金=货币，即财富。然后世界上就掀起了一场夺金热潮，人们为了获得财富，冒着各种危险，飘洋出海，为着黄金不惜一切。也伴随着一些拜金主义的盛行。总体上，金本位的确立，使得民众的奋斗有了一个明确的方向，当所有人都
把追逐黄金当做奋斗方向的时候，这个国家瞬间就有了活力，凝聚力。之后的日不落帝国就是这种内在动力鲜明的写照。
关于金本位的诞生，辉煌，死亡，中间有许许多多故事。有兴趣的朋友可以去找相关的书籍，纪录片等。
其实，牛顿提早一百年确立的黄金与英镑的比例，一直延续下去，就产生了巨大的动力，也使得英镑成为了当时的世界货币，直到二战以后美元的兴起。
如果说把金本位后来的成功，归结到牛顿一个人身上，肯定有点过了。如果说只单纯把牛顿当成一个炼金术士，那也太说不过去了。
私以为，一个人在26岁之前就给未来200多年的科学奠定了基础框架；26岁之后，仅仅制定黄金和英镑比例一事，就足以说明，他的下半生没白活。
前者给科学界，带来了巨大的动力，为后来的工业革命奠定了理论上的基础；后者为英国未来的强大，奠定了良好的经济学基础。
当一个国家，科学和经济上都处在世界的巅峰地位，他能不称雄世界么？
---------------------------------------------分割线-----------------------------------------------------
看到这个话题，想到后世之人对他有很多负面的说法，一口气写下了这么多。写完才发现已经离题了。由于年龄所限关于基督教，神学的诸多内容，基本不熟悉。经过查询，给出一些相对负面的一些言论，作为补充。
6.牛顿在自然科学上的诸多成就算不算神学范畴，以及在神学上到底提出了什么当时西方宗教界，其实并不反对自然科学的研究，教会需要更多的研究成果，以佐证上帝的存在，基督教的伟光正。哥白尼，伽利略由于其正确的科学思维，某些科学成果收到了教会极大的迫害。这种大环境同样对牛顿产生了影响。各种因素的催促下，牛顿也步入了神学的研究。
在宗教方面，牛顿持有一种极端的神论异端思想——反三位一体说。这比当时有一定市场的无神论更甚。三位一体主要讲的是，圣父圣子圣灵是一个神。牛顿认为三位一体说开始据于正统地位的时间即是罗马教廷开始堕落的开端，同时也是千年至福期的开始。所以，他将目光放在公元四世纪，着重探讨了三位一体起源的那段历史，写了许多相关的文章，还通过计算得出基督二世降世的时间再1643年左右，巧合的是，这个时间点与牛顿自己的生日很接近。
他自知这些学说不宜公开发表，他还是在《自然哲学的数学原理》总释以及《光学》的30-31疑问中对其理解上帝的方式做了一些说明。
7.关于150万字的神学手稿
由于手稿中的一些思想与当时主流不符，所以并没有发表。手稿的存在性应该是确定的，要不然思考了这么多，不留下点笔墨也说不过去，至于是否有那么多字。我在网上查了下，有一个纪录片叫《牛顿：黑色异教徒》，这个纪录片的导演说：他话费了50年写下了4500页手稿，试图预言世界末日如何到来。
