《隋唐英雄2》讲述了从隋朝建立到衰亡，李世民登上帝位开创贞观之治的故事，共42集，以下是部分分集剧情介绍：
第1集：剧情围绕杨广展开，杨广如期举行开河庆典仪式，然而敌军突然来袭。面对这一突发状况，杨广表现得镇静自若，有条不紊地指挥大会继续进行。此时，百姓和官员们纷纷跪地，苦苦哀求杨广撤离。但敌军迅速围住了众人，杨广与爱妃张丽华一同被关押起来。另一边，反军攻入宫中，径直朝着太后寝宫奔去。如意领着士兵奋力阻拦，萧妃则大声训斥反军，宇文成都在面对太后时，甚至不敢直视。杨广被宇文化及带到红船上，宇文化及当众宣读杨广的罪状，杨广则据理力争进行反驳。张丽华弹奏了一曲送别曲后，毅然跳江自杀。杨广心灰意冷，要求宇文成都杀死自己，最终宇文成都砍下了杨广的首级。与此同时，如意生下了李世民的孩子，萧妃也确认了杨广的死讯。
后续剧情：李世民展现出思贤如渴的态度，积极广纳人才，许多叛离李密的谋士和大将纷纷投奔到他的门下。秦琼、尉迟恭、程咬金、罗成等将领率领士兵，成功扫平了十八路反王。天下逐渐平定后，李世民的功名日益显赫，这使得李渊在选择继承人时陷入了犹豫不决的境地。李建成联合李元吉，开始排挤李世民。而李渊的优柔寡断，导致朝中政令相互冲突，李世民也因此遭到嫉恨，最终诸子之间兵戎相见。李建成建议由李元吉担任统帅出征，其目的是把握秦王的兵马，并趁机除掉李世民。不过，在萧后的谋划以及秦琼、程咬金等大将的协助下，李世民成功翦除了李建成和李元吉。
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